新宿区のシステム開発会社9選！実績豊富なおすすめ会社一覧【2025年最新版】

新宿区の「実績豊富」「保守・運用に強い」「格安」など、おすすめシステム開発会社9社をご紹介。西新宿、高田馬場、四谷などからアクセスが良く、実績数、開発対応範囲、予算感、運用保守の有無やサービス詳細を徹底調査し、厳選してピックアップしました。 

今回は東京都新宿区のおすすめのシステム開発会社に加え、開発会社選びのポイント、費用相場なども詳しく解説していきます。システム開発でお悩みがある方はぜひご覧ください。

webシステム開発が得意な新宿区のシステム開発会社をご紹介します。
webシステムを導入することには、多くのメリットがあります。たとえば、webの受付システムを導入した場合、クライアントからの商品の注文や予約を24時間受け付けることが可能です。
注文・予約管理もスムーズになるほか、機会損失を失くすこともできるでしょう。

メリットが多いwebシステム開発ですが、どの会社に依頼するべきか分からない方はいませんか？

アイミツでは、専門のコンシェルジュがあなたのご要望を丁寧にヒアリングし、最適なシステム開発会社をご紹介することができます。
お悩みのある方は、ぜひお問い合わせください。

ここから、保守・運用サポートに優れた新宿区のシステム開発会社をご紹介します。
システムは、開発後の定期的なメンテナンスが重要です。スムーズな運用を行うためには、システムアップデートやバグの改善を随時行う必要があるでしょう。

開発だけでなく運用・保守まで依頼した場合、どれほど費用がかかるのか不安な方もいると思います。
相見積もりを取ってみても、料金がバラバラになってしまうことが多く、お困りではありませんか？
アイミツでは、コンシェルジュが丁寧にヒアリングした上で業者を選定するので、ベストプライスの見積もりがすぐに集まります。

国内トップクラスのシステム開発会社登録数の強みを活かし、システム開発会社には書かれていない実際の強み・弱みを元に、お客様にマッチする業者を最大3～4社紹介しています。
もちろん、全て任せるのは不安という方もいらっしゃると思います。
たとえば、自分で探した業者に、私たちがおすすめするシステム開発会社を1社だけ追加して比較してみてはいかかでしょうか？
お気軽にお問い合わせください。

格安で依頼できる新宿区のシステム開発会社をご紹介します。
新宿区には、リーズナブルな価格でシステム開発を提供する企業が数多く存在します。特に、小規模ビジネスやスタートアップ向けに柔軟な対応ができる開発会社を選ぶことで、コストを抑えつつ、業務効率を向上させるシステムを導入できます。

システム開発は、実際にヒアリングを行ってからでないと見積もりが出ないことがほとんどですし、それが適正価格なのかどうかを判断することは困難です。
「単価が高い＝質の高いシステムが構築できる」と考えるのは危険であり、「大手だから」「名の知れた会社だから」という理由だけで発注先を決めてしまうと、同じようなクオリティにも関わらず費用が高くなる可能性も否定できません。

アイミツでは、過去5万件以上の実績データから、要望に応じた適正な予算感をお伝えしたり、今出ている見積もりよりも安い料金で行えるような会社を無料で紹介していますので、ぜひお気軽にお問い合わせください。
また、作りたいものから制作会社を探したい方はこちらをご参照ください。

ここまで、システム開発会社を紹介してきましたが、自社に最適な依頼先を選定するには、どのようなポイントに留意したら良いのでしょうか。株式会社エンジニアリングサムライで代表取締役・ITコンサルタントとして活躍されている坂東大輔氏のアドバイスと共にポイントを確認していきましょう。

システム開発会社を選ぶ際には、現状の課題を整理して要件をまとめた上で、しっかりとRFP（提案依頼書）を作り、その内容を実現できるのか事前に候補となる会社に確認することが重要です。自社の抱えている課題のAs-Is（現状）とTo-Be（理想）を明確にしながらシステムで実現したい内容を精査しましょう。

ここでの提案依頼書を社内でしっかりと揉んでからシステム開発会社に依頼しないと、開発会社によって要件の解釈が広くなり、見積もりが大きくブレてしまいます。依頼側の課題を開発会社にしっかりと伝えることで開発会社も解決したい課題を理解することができます。RFPを作りこむことは開発の初期段階で非常に重要です。

システム開発会社を選ぶ際には、Webサイトやメールでのやり取りによる情報収集だけではなく、相手先に直接足を運んだ上、雰囲気を知ることも重要です。できれば実際の開発現場も見せてもらった上で、最前線で業務に従事しているエンジニアの気力、チーム内のコミュニケーションの様子、全体の活気などをつかむことをおすすめします。これらを実際に肌で感じることで、優秀な会社かどうか、自社にマッチしているかどうかが直感的に分かることがあるためです。

また、プロジェクトの進行には、システム開発会社の管理者、すなわちプロジェクトマネージャー（PM）の存在が大きく影響します。可能な限り事前に直接対面の上でコミュニケーションを図り、ビジネススタンスや自社との相性を確認しておきましょう。

システム開発会社が提示してくる見積もりでも、ビジネスに対するスタンスや信用度を測ることが可能です。金額の根拠や作業内容の詳細が不明瞭な箇所がある場合には、納得できるまでしっかりと説明してもらうことをおすすめします。その際、曖昧な内容に終始するなど、明確な返答が得られない会社であれば、信用できないと判断して問題ないでしょう。また、上述したRFPの内容が確実に反映されているかどうかも重要なポイントです。  

システム開発会社と発注者は対等なパートナーです。請負契約の場合は、要件を基に期待されたWebシステムを開発会社が実現し、その対価として発注者が金銭を支払うという関係性になりますが、プロジェクトの成功に向けては対等な関係でコミュニケーションを図りながら、どちらも自らの責任の下で役目を果たす必要があります。

システム開発会社は受け身であることも多く、発注者側が上から目線で接するようなスタンスを見せるとさらに萎縮してしまうことがあるため注意が必要です。その結果、報告・連絡・相談が不足し、プロジェクトがスムーズに進まないばかりか、トラブルが起きても隠蔽するような事態になりかねません。成功を目指して伴走する同志として、プロフェッショナルならではの積極的な協力を促すようなコミュニケーションを心掛けましょう。

ベンダーロックインとは、特定のベンダーに対する依存度が高く、他のベンダーやシステムに乗り換えることが困難な状況のことです。システム開発会社にすべてを丸投げしてしまうと、ベンダーロックインが発生し、将来的な柔軟性や拡張性の面で大きな問題となることがあります。そのため、上述のとおり対等なパートナーであるというスタンスでコミュニケーションを図りながら、必要事項はすべて共有の上、一緒に作り上げていくという意識を持つことが重要です。

システム開発の費用相場は、基幹システムの場合は250万～3,000万円程度、業務支援システムの場合は60万～920万円程度、Webシステムの場合はシステムの種類によりますが40万～600万円程度の費用がかかるとされています。要件によってはフルスクラッチ開発での高度なカスタマイズが必要となるため、費用が大幅に増加し数千万円規模になることもあります。

参考情報：PRONIアイミツを介したシステム開発取引実績データ

⇩更に詳しいシステム開発の費用相場を知りたい方は、下記の記事を是非ご覧ください。

システム開発には、それなりの費用がかかります。そこで、少しでも費用を抑えたいときに役立つのが国や地方自治体の補助金です。以下にシステム開発に活用できる補助金を3つ厳選してご紹介します。原則、契約前に申請が必要なので、発注先選びと並行して補助金情報を調べるのがおすすめです。

「IT導入補助金」は、ITを活用した中小企業や小規模企業の業務効率化・売り上げの向上を目的とし、ホームページ作成、クラウドツール・業務用ソフトウェアの導入にかかる費用の一部を補助します。最大補助額は450万円・補助率1/2以内です。

出典：IT導入補助金2022　https://www.it-hojo.jp/　 

「ものづくり補助金」は、中小企業・小規模事業者が制度変更などに対応するための革新的サービス開発、設備投資などを支援する補助金です。「一般型」と「グローバル展開型」「ビジネスモデル構築型」に大別され、さらに「通常枠」や「デジタル枠」などの枠も設定されています。最大補助額は3000万円で、補助率は1/2または2/3です。

出典：ものづくり補助金総合サイト　https://portal.monodukuri-hojo.jp/index.html

「持続化補助金」は、小規模事業者が制度変更に対応し、持続的な経営を実現するために必要な、ホームページ制作など販路拡大に関わる経費を一部補助するものです。通常枠または特別枠（賃金引上げ枠、インボイス枠など）の申請類型いずれか1つの枠のみ申請可能。システム開発にかかる費用はウェブサイト関連費に計上され、最大補助額は200万円・補助率は1/4です。

出典：小規模事業者　持続化補助金（一般型）https://r3.jizokukahojokin.info/

補助金について、さらに詳しい情報を知りたい方は以下の記事をご覧ください。

補助金を利用する上で何より大切なのは、規定に沿ってきちんと申請を行うことです。事業計画書、経費明細書など、必要な書類は各補助金・助成金の公式ホームページに記載されているため、もれなく準備し、不備のないように記載しましょう。

しかし、補助金申請は揃える書類や申請項目も多く、業務が煩雑になりがちです。スケジュールをきちんと把握しておらず、「気がついたら申請期限を過ぎていた」なんてことが起こる場合も。

「アイミツ」は、申請をスムーズに進められる補助金に詳しいホームページ制作会社を厳選し、「無料」でご紹介可能です。ぜひお気軽にお問い合わせください。

価格で失敗しないために、『システム開発の費用と料金相場』で相場や価格帯ごとの制作例を確認しておきましょう！

システム開発の相場はエンジニア人件費が高騰していることから、上昇傾向にあります。平均相場は233万円ですが、アイミツコンシェルジュが話を聞いてみると月額数千円から利用できるパッケージなどがすでに存在するケースも多いので、お気軽にご連絡ください。


アイミツでは、公開されていない各社の料金や実際に依頼したことのあるユーザーの実績をもとにした『”価格で失敗しない”一括見積もり』をおすすめしています。